Es el sistema cuyo objetivo es proteger a la persona y a la sociedad ante la eventualidad de un desastre, provocado por los agentes naturales o humanos, a través de las acciones que reduzcan o eliminen la pérdida de vidas, la destrucción de bienes materiales, daño a la naturaleza y la interrupción de las funciones esenciales de la sociedad, así como procurar la recuperación de la población y su entorno a las condiciones de vida que tenían antes del desastre.
Por tanto la CEPQ es parte integral del Sistema Nacional de Protección Civil, perteneciendo como organismo desconcentrado a la Secretaría de Gobierno del Poder Ejecutivo de Gobierno del Estado de Querétaro.
